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6163银河线路检测中心生物多倍体植物基因多样性分析SSRseq®专利技术简介及其应用
发布时间:2023-11-15

SSR简单重复序列(Simple Sequence Repeat,SSR),也称微卫星(Microsatellite)或短串联重复序列(Short Temdem Repeats,STR),其串联重复的核心序列常为1-6 bp,是一种广泛分布在真核生物基因组中的重复序列。由于其自身具有共显性遗传,多态位点多,信息含量丰富,物种间转移性好,易于检测,重复性好的特点,因此广泛应用于动植物遗传多样性、亲缘关系分析、品种鉴定、分子标记辅助选择、QTL定位等研究。

6163银河线路检测中心生物依托自身技术优势,开发出了基于Illumina二代测序平台的SSRseq®超高通量SSR分型技术。该技术针对目的区域SSR设计多重PCR扩增体系,一个扩增反应体系可以完成15个SSR标记的PCR反应,然后对目的片段进行二代测序。此技术可以直接检测到同一SSR位点不同等位基因的序列信息,不但能达到单碱基分辨率,并且能够准确给出每个等位基因SSR重复单元的具体重复次数和不同等位基因的相对比例,不需要人工判读基因型,基于生物信息学分析流程高效、准确分型,适用于二倍体物种,尤其适合异源多倍体物种SSR位点检测。您只需提供样品DNA及SSR位点信息,我们便可帮您完成从实验检测到数据分析整体服务。

如果您对我们的SSRseq®技术感兴趣,那就抓紧时间约起来吧。

讲座内容概要

1、SSR简介

2、传统SSR检测方法及不足

3、SSRseq®技术特点及优势

4、SSRseq成功案例 -- 六倍体油茶SSR检测

部分客户文章

1.High-throughput sequencing-based microsatellite genotyping for polyploids to resolve allele dosage uncertainty and improve analyses of genetic diversity, structure and differentiation: A case study of the hexaploid Camellia oleifera, Mol Ecol Resour., 2022 

2. SSR-Sequencing Reveals the Inter- and Intraspecific Genetic Variation and Phylogenetic Relationships among an Extensive Collection of Radish (Raphanus) Germplasm Resources, Biology (Basel)., 2021

部分课件内容

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