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小鼠285K甲基化芯片检测
  • Infinium Mouse Methylation BeadChip(285K)为小鼠的全基因组DNA甲基化研究提供了全面的、专家选择的覆盖范围和高通量的独特组合。该芯片能够以单核苷酸分辨率检测每个样本中的超过285k个甲基化位点,提供了对CpG岛、翻译起始位点、增强子、印迹位点和其他区域的均衡覆盖。该芯片实现技术重复可重复性为98%,与WGBS测序数据高度相关。

    技术路线:

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    技术优势:

    全面覆盖:每个样品能够检测超过285K甲基化位点,实现单核苷酸分辨率;

    简单流程:无PCR流程,使用强大的Infinium HD检测进行表观遗传学研究;

    高重复性:技术重复性超过98%;

    广泛应用:支持全表观基因组关联研究、异种移植实验、临床前研究等。




  • 数据分析内容:

    1) 原始数据探针和样本质控

    2) 探针矫正和Beta值预处理

    3) 原始甲基化位点信息

    4) 整体甲基化差异分析

    5) 甲基化差异位点分析

    6) 甲基化差异区域分析

    7) GO和KEGG富集分析

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    图 数据分析流程





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